天然水の保存期間について。

現在自宅は上水道が整備されていませんので井戸水を常用使用しています。
水質検査を年２回以上行っています。検査用の水を採取するときは３０分位井戸水を出しっぱなしにしてからの水を検査します。もちろん業者さんが来宅し採取するのですから消毒済みの容器に入れ持ち帰ります。
それでも一般細菌は微量ですが検出されますので飲料に敵する結果が出ていますがほとんど生水では飲みません。
保健所に問い合わせ、その自然水を持ち込み検査してもらえば数値と共に飲料に敵、不適が判明すると思います。
有機物など含まれていないと思いますが一般細菌の数値にはびっくりすると思います。

一般に市販されている天然水でも
開栓後は概ね２週間以内が消費期限となっています。
市販は常温で保存していても密閉された容器ですので、湧き水を汲んだ場合は、密閉は不可能ですので、最大でも2週間以内だと思います。
また、飲む際には沸騰させてから飲むようにした方がよいと思います。

空気中にさまよう菌がいます、
無菌室で容器に入れない限り、
容器に一緒にはいる、
だから長期保存は無理と思う。

「天然水で無菌」ってあり得ないことだと思いますょ
”濁りが無い＝無菌”ではありませんょね。
仮に無菌に近い状態であっても、他の方がおっしゃる様に、容器そのものが無菌ではないので、決して安全とは言えないです。

本題ですが、菌が必要とする栄養素（有機物）が少ないのも確かですから爆発的な繁殖はないと思いますが、
常温保存だと、いいとこ２〜３日ではないでしょうか？

バイキンの事に関して
　例え湧き水が無菌としても、採水時まで無菌を保つことは不可能です。ま更に、容器も消毒しなければ意味ありません。余程慎重にしない限り無菌を保つことは不可能です。
　理論的には、仮に１個の細菌や藻などが入っていたら、長時間のうちに繁殖することが充分考えられます。

　私の知ってる市が設備した採水所には、必ず沸かしてから飲むよう注意書きがあります。特別設備されていない所でしたら、素性はわからず、利用は自己責任でしょうね。

私の近くにも沢山の名水が有ります、一番評判の良い所の水を汲んできています、２０リッタ３缶常温で台所にほったらかし、数ヶ月何ともないです、同じ水でも、緑の藻が付くと言う人もいます、この違いが分かりません。
お腹壊すようで有れば、合わないのかも。

細菌以外にも

水には、硬水と軟水と言う物が有ります。

又水の中に含まれているミネラル成分や他の成分が
体に合わないにかもしれませんね。

しばらく飲まないで、体の調子を見たら如何？