天台宗の寺院。本尊は慈恵大師良源（元三大師）像。
比叡山延暦寺の表参道である本坂口及び日吉大社の表参道脇にある。

元亀2年 (1571年)に織田信長によって行われた比叡山焼き討ちによって全焼した。その後、再建されたが再び焼失する。慶安元年（1648年）に延暦寺東塔南谷西尊院の古堂を移築し、元三大師堂とする。正徳4年（1714年）、元三大師堂が改築される。


旧竹林院を出て、芙蓉園の前を通り、官幣大社「日吉神社」境内に入った。

境内は重文あり、様々な王宮あり、広くて回りきれない。
散策地図をもらわなかったので、延暦寺中高まで下ってしまい、戻ったので時間ロスした。