回答になりませんが、私は基本的にデータ保存はハード・ディスクではなく、「ＣＦメモリ、メモリスティック」を使っています。
なかには「外部メモリは駄目」と言う設定のソフトもあるので、その場合は一端　Ｄドライブに作っておいたフォルダーに保存して、後からフォルダー毎コピーしています。
「上書きするかの問い合わせに答える」のが面倒なので、フリーソフトの「自動バックアップ」を使わせて頂いていますが。
最近は高容量のメモリが安価で手に入りますし、抜いて他のパソコンでデータを使う事が出来るメリットからです。
私もＶＡＩＯ党で　ＰＣＧ−Ｃ１ＸＧ／ＢＰ　から使い始め、現在は量販店で　”展示落ち・半額”の　ＶＧＮ−Ｋ５０Ｂ　を使っていますが、ウィンドウ用パソコンを今度買う時は　ＶＡＩＯから離れて”ＤＥＬＬ製パソコンか、ＴＨＩＮＫＰＡＤタイプ”辺りにしようと思っています。
理由は”使わない余分な機能が付いていない・使いたくなったら、後から付け足せば良い・ＶＡＩＯのリカバリーに嫌気がさして来た・あまりに次から次へと新タイプが出てくる・音楽等はＭＡＣの方が使い易い”等々が理由です。
ＶＡＩＯのアップグレードですが、ウィンドウのアップグレードも同じで、私は内容をみて必要がないと思えば、そのまま無視。
必要と思えれば、あらかじめ操作説明のところをメモしておいて、操作手順に従ってアップしています。
ウィンドウの方は、あらかじめ設定しておけば自動的にアップしてくれますが、例えば”ＩＥ７”等についてはアップする必要がないと思いましたので、”非表示”にしました。
最近、やたらと肥満化ソフトを搭載したパソコンが多いですね、ＶＡＩＯもそのひとつですが。
メーカーも売らなければ食べていけないのでやっているのは分かりますが、すこし行き過ぎではと思うのは私だけでしょうか。
と言って、最近売込みが盛んになった５万円以下の価格を売り物にした「ネットパソコン（間違っていたら、ごめんなさい。）」にも、どうもねと思っています。

先ず、質問の内容は２つあると思います。Ｓｏｎｉｃ Ｓｔａｇｅは、通常、音楽をＰＣで聴かれますか、ということとＳＯＮＹのメモリー・オーディオＷａｌｋｍａｎをお使いですか、ということです。音楽ＣＤをＰＣにコピーして、Ｗａｌｋｍａｎで聴かれるのであれば必要です。それでなければ不要なソフトだと思います。
ＶＡＩＯのアップデートには、２種類あります。なぜだか分かりません。クリックすれば、アップロードするものと、どこかにファイルをコピーするものがあります。普段使っているソフトはアップロードしていったほうが良いでしょう。アップロードするしないはチョイスできますので、簡単に出来ます。ファイルをコピーするものは、ＶＡＩＯ ＵＰとか何か、分かりやすいフォルダを作って保存するほうがいいでしょう。

SonicStageは、独自の権利処理をしているソフトですね。
WindowsMediaPlayerでも同じようにCDを取り込んで
PCで再生できるので、よほどのSONY信者でないと使わない
のでは？と感じています(ここは主観です)

で、もし、これをお使いであれば、バージョンアップすべき
と思いますし、使っていないなら、無視して問題ないと思い
ます。他の方も書かれている通り、使っていないようでしたら、
アプリケーションの追加と削除で削除してしまうという手も
ありますね。

「バックアップしてください」というアナウンスは、万が一
データ領域の情報を消してしまっても責任をもてませんよ、
という意味で、データを全部消されてしまうというものでは
ないことが多いようです。

ま、お手持ちのCDを取り込んであるのなら、再度取り込めば
いいので、それほど重大に考えなくてもいいと思います。

こんにちは。
ソニーVAIOも所持しておりますが、そのツールは使ったことがありませんが、使用していて何か不具合でもありましたか？
なにもなく不便も感じていないのであれば無理してアップグレードする必要はないかと思います。
バックアップもなにも専用ツールを使う必要はありません。
当該ソフトの保存フォルダのなかにデータフォルダがあると思いますが、そのフォルダごとなにかCDやメモリなどに
エクスプローラー上からコピーすれば大丈夫です。
ただし、楽曲などは著作権問題などがありますので
慎重にしてください。

私はSonicStageを使いませんから、ＰＣの容量をふやすためソフト本体を削除しました。
あなたはSonicStageをお使いなら、せっかくですからバージョンアップされたほうがいいでしょう。

ご質問の内容は、何もVAIOに限った事ではありません。
不要な（使わない）ソフトのアップグレーは、する必要はありません。
ただし、ＤＡＴＡのバックアップをとる癖は付けましょう。