揉めるはずがないと思っていた相続問題で悩んでいます。

主人の家（相続権者子供５人ー男２人、女３人の兄弟姉妹）でも公正証書の遺言書があり、揉める筈のない相続が兄嫁の「分配は公平に！」との一言で揉めましてね。

主人は次男ですが、家業を継ぎ両親と同居し、両親の終焉も看取りました。
義兄は東京の大学を卒業し、国家公務員となり、盆・正月も帰省して両親の様子を見ることもなく、全て家のことは主人任せでした。

兄嫁の一言で黙っていた姉が「相続権のないあなたには発言権はありません！黙っているかこの場から出て行きなさい！家を守ってきた弟と其の嫁に対して少しは感謝する気持ちを持ちなさい！あなたの主人である弟は二男に家のことや両親の面倒を任せっきりで、いいえ、盆・暮れに帰省して両親を安心させることもしないで自分勝手な生活を送ってきただけ！権利を主張する立場にない身だということを理解しなさい！」と言い、続けて
「私は遺言書の記載事項に同意して、そのまま相続することを承認します。何もせず弟に任せっきりで何も貢献せず、自分勝手に生きてきたお前は何か不服があるの？」と義兄に尋ねました。
義兄は小声で「遺言書通りで異議ありません！」
姉は義姉に「あなたは発言権はないけど、今の弟の同意に対してあくまで平等を主張することを弟に要求するの？異議あるの？」兄嫁は黙って俯いていました。
二人の義妹は「姉さんの言うとおり、遺言書通りでの相続に同意します。」と言い、義妹たちのご主人からは何の反応・発言はなく纏まりました。

なお、義姉から「遺言書どおりといったけど、ちょっと変更したいと思うので提案します。家を守り両親の面倒を見てくれ、帰省した私達を温かく遇してくれた二男嫁に対して、それぞれの取り分から２百５０万を贈ることを提案したいけど、どうかな？」
義兄も義妹達も賛成の意を表してくれました。

相続権者で取り仕切ってくれる義姉がいたお陰で揉めかけた相続の話し合いが上手く纏まりりましたね。

相続権者以外の人の発言が纏まるものを揉めさせる原因を作ることになることがあります。
特に嫁や婿さんは発言を極力控えましょう！
ましてや自分の立場で主張することは厳禁だと思います。

遺言の内容を見て、その上で生前の贈与なども調べないと、実は、遺留分減殺請求できるのかどうかわからないのですが・・・

とりあえず、わかる範囲で回答します。

まず、借金ですが、遺留分とは直接関係ありません。
借金（貸金債権）として、相続されるのですが、

＞義母は借入金の残高は義父に返済するようにとの書付を残しています。

とのことですね。
この書付が、家裁で検認を受けた遺言のことなのか、
それとも別の紙に書いているだけなのかによって変わってきます。

仮に二男がお母さんに６００万円借りていたとします。
遺言の中に書いてあった場合は、借金（債権）をご主人に相続させる、という意味になりますから、
二男は６００万をお父さんに返すことになります。
「返せ」と請求する権利は、お父さんだけです。

遺言に書いてあるのではなく、別に、メモのように書いてある場合ですと、
二男の借金６００万円は法定相続します。

相続人が、ご主人とお子さん３人ですから、法定相続分は、
ご主人が６分の３、お子さん３人が各６分の１ずつですね。

お父さんは二男に「３００万返せ」と言えますし、
長男と三男はそれぞれ二男に「１００万返せ」と言えます。
二男が相続した１００万円は、債権者と債務者が二男ですから、チャラになります。

二男の遺留分は、法定相続分６分の１の２分の１ですから、遺産総額の１２分の１です。

遺産総額とは、
１、お義母さん名義の不動産、預貯金、株などの有価証券、車などの財産全部
２、お母さんが亡くなる前１年間の贈与、
３、特別受益（養子縁組や婚姻のための持参金や、商売のもとで、マイホーム取得のための資金をお母さんからもらった場合）
…この３つを足して、借金を引いた金額です。

二男が住んでいる不動産はお父さんの名義だとすると、特別受益にはあたりませんね。
大学の進学資金も、兄弟の中で１人だけ進学させてもらった場合には、特別受益にあたるとか（判例です）、細かい事情がわからなくては何ともいえませんが、計算上は、遺留分を侵害している可能性もありますね。

遺言と、通帳、不動産登記事項証明書、固定資産評価証明書、これまでの贈与などの経緯を書いたメモを持って、専門家に相談した方がいいかもしれません。遺留分は１２分の１ですが、具体的な金額が出ませんから。

あるいは、無視して、二男が調停を申し立てるのを待つ、ということもありだと思います。
遺留分減殺請求は「遺留分を侵害しているから返せ」といえば、効力が発生します。
でも、具体的に、いくら返せばいいのかは話し合いに寄ります。でもなかなか話し合いで解決しないので、調停で決めてもらうしかない、ということも多いです。

また、例えば、二男の遺留分を侵害しているとしても、お父さんが（仮に、先ほどの借金の例ですが）６００万円の債権を取得したとすると、その金額も、二男の遺留分を侵害している可能性があります。
つまり、あなた方が取得する不動産だけの問題ではないので、非常に面倒な計算になりますし、それでも二男が納得しなければさらに時間がかかります。